IDEA PRINCIPAL
El protagonista es Nodé. Arceus te encomienda capturar todos los Pokémon de La Tierra (de ambos géneros) y subirlos a tu arca antes de la catástrofe mundial.
-Año 1039 Después de Arceus-
Nodé está a punto de cenar cuando un Togekiss intenta entrar por su ventana sin éxito, ya que estaba cerrada.
Nodé, curioso, le abre la ventana para recibir la carta que el Togekiss tenía adherido a su espalda.
No se lo creía, el mensaje era del superior, el creador e infinitísimo Arceus; en el cual le pedía que capturase a todos los Pokémon del mundo de cada sexo para después meterlos en el Arca de Nodé.
El hack, comenzaría aquí.
Luego Nodé (el prota, tú) tendrá problemas para encontrar especímenes Pokémon de diferentes sexos, puesto que algunas especies no tenían género. Por ello, Arceus crea para él un nuevo Pokémon, Ditto.
Más tarde, le queda la misión más difícil de todas: visitar todos los lugares del mundo Pokémon y encontrar a todos los legendarios para tenerlos también, como no, en su arca; y salvarlos así de la catástrofe que se avecina.