Creo que te puedo echar un cable, jefe. Vamos por partes.

1.-Para traducir el mensaje al español: Te vas al editor externo (el Editor.exe que viene en tu carpeta de Essentials) y le das a "Extract Text". Se habrá guardado en intl.txt o algo así en la carpeta de essentials. Abres el intl.txt y buscas el mensaje. Te saldrá repetido dos veces. Editas la línea de abajo a tu gusto (SOLO la de ABAJO). Guardas el archivo, vuelves al editor y le das a "Compile Text".

2.-Para lo del científico de las Balls: tienes que poner un evento con interruptor local para que no se repita. Tienes que poner un evento en el lugar por donde vayas a pasar y en el que quieres que te detenga. Un evento que se accione al toparse con el protagonista. Haces que al pisar el evento, el científico camine hacia ti. Te diga algo (lo que tu quieras) y te de las Balls. Luego le dices que active un interruptor local. Creas una nueva página de evento en la que no haya nada, y que se active al estar ese interruptor local activo.

3.-Para poner entrenadores: es con otro evento. Te recomiendo que aprendas por ti mismo a hacer este tipo de eventos. Mira en los mapas de prueba que vienen con el Essentials. Ahí hay eventos de entrenadores de ejemplo para que hagas los tuyos propios, pero si no te queda claro, mira en el archivo Notes.html que te viene con el Essentials o en Pokemon Essentials Wiki. Te dejo el link.
Trainers - Pokémon Essentials Wiki

4.-Para borrar la partida guardada: Esta es muy fácil. Cuando guardas el juego, en tu carpeta de Essentials se genera un archivo guardado que se llama Game.rxdata o algo así. Lo único que tienes que hacer es borrarlo.

PD: Si tienes alguna duda con eventos, me la preguntas por MP. Yo te puedo enseñar, si quieres.