Dante explicó cómo editar el combate, mediante hex, en este tutorial: http://wahackforo.com/t-Como-editar-la-batalla-de-WALLY-y-Ralts-HEX
También me suena haber visto una herramienta para editar el combate más fácilmente, pero ahora mismo no recuerdo su nombre... =/
Espero que mi respuesta te sirva. Suerte con eso =)
Ray Laé Àlfori (Rayku Rayquaza)
PD: Seguramente me estoy confundiendo con otra herramienta para editar la batalla con Poochyena xD Creo que tendrás que hacerlo a mano...
Edito: Perdona, no te había entendido xD Nunca he editado ese script, así que no puedo ayudarte. Sorry.