Para jugar con los ips...
Entra en el emulador Visual Boy Advance y asegurate de tener marcada la opción Options/Emulator/Automatic IPS Patching.
Luego crea una carpeta nueva y mete una copia de la ROM base que utilice el juego (Puede ser Ruby o FireRed) y el parche del Hack.
Ahora renombra alguno de los 2. Para que ambos queden igual, pero con extensión distinta, por ejemplo: PokémonQuartz.zip para la ROM y PokémonQuartz.ips para el parche.
Una vez hecho esto carga la ROM en el emulador y ¡a jugar!

Nota: Existen otros métodos pero este, considero yo que es un poco más sencillo.