Por scripts no es posible.
Puedes eliminar al pokemon que tu tenias, y hacer un givepokemon con su evolucion.
Despues, para tener otra vez sus movimientos y sus PPs y tal, debes hacer esto:
http://wahackforo.com/t-25420/gba-scripting-cambia-movimientos-pp-cualquier-pokemon-tu-equipo

Con eso, tendras a tu pokemon "evolucionado" de la manera mas creiblemente posible.