Si la imagen está indexada a un numero reducido de colores puedes abrirla con el paint viejo y probar a pintar con un color de los que vienen a un lado. Si al pintar el color que se ve no es el que elegiste y es uno de los de la imagen, entonces está indexada. Yo pruebo con el rosa o el verde brillante, que no los usa nadie xD Así no tienes que probar con el character maker ^^

Eso sí, para indexar, character maker o photoshop (a mi me gusta más porque tiene más funciones y es más fácil editar los colores).