bueno mira en mi opinion que he probado de los dos (bueno hace poco me movi a esto del RPG maker) te digo que la verdad depende mucho de lo que necesites y de lo que quieras hacer en tu juego...si no necesitas hacer mucho graficamente, y un juego con scripts sencillos y sin mucho trabajo bueno podrias hackear en gbc pero ahora si necesitas mas pokemon gba seria lo ideal y bueno si necesitasaun mas un RPG podria ser lo tuyo, esto es solo un pequeño ejemplo si me dejo entender, solo busca primero lo que necesitas y cual te conviene mas ;)

ROM hacking es un orgasmo
RPG maker tambien hahaha :D