Por favor, busca un poquito por el foro, y verás en la zona de tutoriales esto: http://wahackforo.com/t-26236/gba-otros-crear-nuevas-piedras-evolutivas-sin-sustituir-desde-cero-cualquier-rom-3-gen
Estaba en la segunda página.
Como tu lo estas intentando hacer no te va a salir nada xD. En ese tuto explico TODO para hacer lo que quieres. Además te dejo unas herramientas para descargar útiles y mejores que el Pokémon Amplifier :)