Yo creo que eso se podría hacer, pero no con scripts, si no con ASM.
Pero tampoco estoy 100% seguro, el caso es que cuando atrapas a un Pokemon llama a una rutina en el que te da a elegir mote y lo manda a la caja, habría que hacer que llamase a la rutina nueva que tu pides, pero no creo que fuese exclusivo para esos pokemons, si no que pasaría con todos. Eso es lo que creo, no estoy seguro.