Con el comando de desvanecer, y a la vez el de desactivar evento.
Eso para que desaparezca el item.
No te lo puedo explicar mejor porque también soy novato en esto del scripting.

Ahora, para que no puedas coger a Eevee 20.000 veces:
-Debes activar una flag en el script antes de que finalice:
(con getflag 0x****)
-Debes poner una revisión de flag cada vez que comience el script:
(checkflag 0x****)
-Si quieres puedes poner un script alternativo si el flag está activo:
(con If 0x1 goto @ejemplo)
Por ejemplo:

#org @ejemplo
msgbox @texto 0x6

#org @texto
= Ya cogiste a Eevee antes.