Poder se puede, pero no te lo aconsejo mucho y eso que soy el primero que quiere hackear un juego de NDS... xD
Es bastante más difícil y aún no se conocen muchos detalles, pero puedes pasarte por la zona de turoriales de nds para informarte.
Hace un tiempo postearon un tutorial con el que enseñaban a mapear en NDS, lo que supuso un gran avance (aun así yo no fui capaz de conseguirlo xD).

Mucha suerte intentando eso de la nds, yo creo que esperaré un poco más a que lo faciliten ^^U