¿quieres decir que cuando ensamblas el archivo .s, y exportas los tracks, cuando los pones en otro rom, es decir, los importas (sustituyendo la misma canción que en el otro rom) suena la misma canción, es decir, la predeterminada del juego?
si es eso, tal vez no tuviste cuidado a la hora de exportar los tracks y exportaste los tracks de la canción original, es decir, sustituyes la canción predeterminada por la predeterminada.