Umm... Bueno, quizás estés haciendo algo mal...
¿Qué rom estás intentando abrir? ¿Funciona modificando el archivo GBA o tienes que descomprimirlo? Creo que puede deberse a una incompatibilidad o a que no estás cargando el rom de manera correca. Aunque no estoy muy seguro...

~Tema movido a Dudas